Caesar en zijn apen worden in een dodelijk conflict gedwongen met een leger van mensen, geleid door een meedogenloze kolonel. Nadat de apen onvoorstelbare verliezen lijden, worstelt Caesar met zijn duistere instincten. Hij besluit om zijn soort te wreken, deze beslissing zet Caesar en zijn apen tegenover een leger van mensen in een episch gevecht. De uitkomst van dit conflict bepaalt niet alleen het lot van beide soorten, maar ook de toekomst van de planeet.